ImageJ 다운로드 오류 해결방법 및 설정
ImageJ 다운로드 오류 해결방법과 ImageJ를 원활하게 사용할 수 있는 설정 방법에 대한 포스팅입니다. 실험실에서 Sholl analysis를 하기위해 ImageJ를 설치했는데, 설치과정 중에 어려움이 있었고, 지금은 해결했지만 혹시 다른 사람들도 같은 오류로 헤매고 있지 않을까하여 올려봅니다.
ImageJ로 sholl analysis (DG, CA1) 를 하는 방법은 다음 포스팅에서 설명하겠습니다.
I. ImageJ 다운로드
1. http://imagej.net 홈페이지에서 내컴퓨터 우클릭으로 Fiji를 다운로드한다. Fiji는 ImageJ + alpha인 프로그램으로, Sholl anaylsis에 필요한 프로그램은 Fiji이다. ImageJ 단독으로는 실행이 불가능함. FijiJ가 ImageJ보다 상위버전이므로 FijiJ를 다운로드합니다.
2. Fiji 폴더의 위치는 \program files 보다는 \document 나 바탕화면 같은 \user\ 에 지정해 놓는 것이 에러가 나지않는다.
3. Java8 이상의 버전에서 작동하므로 java 홈페이지에서 다운로드한다.
* 만일 Java를 설치했는데도, ImageJ를 실행시키면 도스창에 could not find javaw.exe in PATH 라는 오류가 나올 때는,
바탕화면 빈공간 마우스 우클릭 – 시스템 속성 – 환경 변수 – 시스템 변수, 새로만들기 – 변수 이름: PATH – 변수값은 Java 설치 폴더 경로 \bin 으로 지정한다. 예를 들면, C:\Program Files (x86)\Java\jre1.8.0_151\bin – 확인
II. 배경색 지우기
1. Color picker 클릭 후 배경화면 아무 곳에 찍어서 배경색을 추출하고
2. Rectangle (경우에 따라서 다른 선택도구도 상관없음) 클릭 후 지우고자 하는 범위를 지정한다.
3. ctrl+F 를 누르면 선택영역 내부가 지정한 색으로 채워진다.
III. 선 색 변경하기
1. ImageJ를 설치하면 기본적으로 선색이 노란색이라 밝은 화면일 시 구분하기가 어려운데, 그때 사용할 수 있는 선색을 변경하는 방법이다.
Edit - Options 에서 다양한 옵션 설정이 가능하다.
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